江苏疾控首次鉴定出新型环状单链DNA病毒:深夜草莓app污下载地址

作者:草莓视屏app安卓黄下载发布时间:2021-05-28 00:20

本文摘要:该病毒就是我管理中心病源所对2020年9月27日江苏省出入境签证检验检疫检测的一例从马来西亚归国的筋挛患者咽拭子样本进行病原菌检验后扣减。病源所试验室工作人员根据对检测样本用高通量测序技术性检验寻找在其中所含一种新式环形单链DNA病毒精彩片段,后依据高通量测序reads编码序列设计方案特异性引物设计,对患者咽拭子样本进行PCR扩大,物质历经sanger转录组测序、编码序列安装,于10月26日获得该病毒总长基因序列3018nt。

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该病毒基因含2种关键扩大开放读码框(ORFs),各自编号复制酶蛋白Rep和衣壳蛋白Cap;有两个遗传基因间距区,在其中大的间距区所含环状病毒特征茎环构造。与该病毒最相仿的为粪肥涉及到的环状病毒5(porcinestool-associatedcircularvirus5(PoSCV5),isolateCP3),编号蛋白氨基酸序列相似度大概为43%和50%,演变剖析表明了这2种编号蛋白各自与环状病毒科及未分类的环形单链DNA病毒聚为一类,疑似为一种新式病毒。

可行性分析将该病毒取名为HumanPoSCV5-likecircularvirus(isolateMRJ),基因组序列已提交GenBank数据库查询(Accessionno.KY052047)。


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